Соответствует программе курса «Математическое моделирование водных экосистем» который читается в Сибирском федеральном университете магистрам первого года обучения по направлению «Математика и компьютерные науки». В пособии с одной стороны излагаются стандартные принципы математического моделирования с другой - оригинальные результаты авторов в области натурных измерений и проведении численных экспериментов для расчета экологических состояний конкретных водных объектов. Для лучшего усвоения материала пособие снабжено списком вопросов и задач. Предназначено для студентов обучающихся в магистратуре по направлению 02.04.01 «Математика и компьютерные науки» и преподавателей ведущих учебные занятия по дисциплине.