Предлагаемый способ управления позволяет обеспечить точность и надежность управления процессом производства биомассы аэробных микроорганизмов и создать условия для реализации энергоэффективной технологии в непрерывном режиме эксплуатации основного и вспомогательного оборудования. Подключение пароэжекторной холодильной машины, работающей в режиме теплового насоса, к управлению тепловыми и материальными потоками в замкнутых термодинамических циклах, позволяет реализовать способ управления как энергосберегающую и экологически безопасную биотехнологию с минимальной погрешностью при стабилизации абиотических факторов. Поддержание оптимальных параметров и режимов позволяет получать ценный ферментный препарат инулиназу, применяемую в диабетическом питании для получения фруктозы и продуктов на ее основе.